在我们区分这两个专业的之前，首先让我们先来了解一下软件工程。
软件工程硕士(MSE)与传统的研究生教育不同，教育比较重视课程设计、职业设计等方面的实用性;以市场需求为导向，以培养具有国际竞争能力的多层次实用型软件人才为目标，面向国民经济信息化建设和发展的需要培养高层次实用型软件人才。
因此，从上面的概念上就使我们很容易对软件工程与计算机硕士作出区别：
二者均属于国家正规的硕士研究生培养，软件学院侧重于适应市场需求、加强实践和双语教学与企业合作联合培养。
从培养模式来看，软件工程注重应用，计算机硕士注重学术研究。
从培养目标来看，软件工程是培养“国际一流的高层次实用型软件人才”，主要是计算机+管理。计算机硕士培养学术尖兵。
从就业前景来看，虽然我国高校现有计算机系大约500个，一年的毕业生约在万人以上，但由于计算机硕士主要还是以学术研究为目的的研究人员，与企业的实际需求有一定距离。而软件人才缺口就更加大,尤其是一些高层次、复合型的技术带头人。因此软件工程硕士的这种发展对想要报考在职研究生的在职人士来说也是一个很好的机会。
